O treinador de 41 anos substitui Massimiliano Allegri, que foi demitido após terminar a última temporada na quinta colocação da Serie A.
"É um desafio que abraço com orgulho e entusiasmo, totalmente ciente do que essas cores significam," Amorim disse em comunicado.
Tanto o Milan quanto Ruben Amorim tiveram uma temporada para esquecer em 2025/26.
O clube italiano busca se reestruturar após uma campanha decepcionante que o deixou fora da zona de classificação para a Champions League.
Já Amorim foi demitido do Manchester United no início do ano. Ele deu adeus aos Red Devils após 63 jogos e um aproveitamento de apenas 47%.