Tentando conquistar o triplo de títulos mundiais nos 400-800-1.500, o atleta de 21 anos ficou em 17º lugar nas eliminatórias dos 400, depois de registrar um tempo lento de três minutos e 48,05 segundos.
Vice-campeão atrás do australiano Sam Short no evento do ano passado em Fukuoka, Hafnaoui se recusou a falar com os repórteres após o revés.
Ele tentará defender seus títulos de 800 e 1.500m no estilo livre mais tarde no evento.
O ex-campeão mundial da Austrália, Elijah Winnington, foi o que se classificou mais rápido para a final dos 400 metros livres no domingo, com o tempo de 3:44.37, à frente do alemão Lukas Maertens, medalhista de bronze em Fukuoka.
Kim Woo-min, da Coreia do Sul, classificou-se em terceiro lugar para a final.
A campeã mundial Kate Douglass se classificou com o melhor tempo para as semifinais dos 200 m medley individual feminino, vencendo sua bateria com facilidade com o tempo de 2:10.01.
Sydney Pickrem, do Canadá, foi a segunda mais rápida (2:10.97).